. FAQ Maladie



Les derniers éléments mis à jour dans les fiches figurent en bleu.

Absences

Comment faire si j’ai 2 arrêts, avec un motif différent, qui se suivent ? 

Le logiciel considère 2 arrêts juxtaposés comme une prolongation si aucun type d'arrêt n'est coché. 
Pour distinguer le premier arrêt du second, cocher la case "Initial" permet au logiciel de considérer le second arrêt comme un nouvel arrêt. Ainsi, une nouvelle période de carence est appliquée (7 jours pour le maintien employeur et 3 jours pour le versement des IJSS).

Exemple : Un premier arrêt maladie non professionnelle pour une grippe (du 1er du mois au 07) suivi d'un second arrêt maladie non professionnelle pour une gastro-entérite (du 08 du mois au 12).


 

Cas des arrêts après un congé maternité : Cocher l'option suivante sur l'attestation maladie lors de la génération de l'absence maladie.

Pourquoi l’absence est en heure alors que le suivi des absences est en jours calendaires ?

Dans la fiche Société, le traitement des absences est paramétré en jours calendaires et le suivi des absences est paramétré en jours ouvrés :

 

Sur le bulletin, l'absence est toujours en heures, malgré le paramétrage en jours :

 

Cela vient du comparatif réalisé par le logiciel pour les absences, qu’on appelle  "tassage de l’absence". Pour avoir un nombre de jours sur le bulletin, indiquer 97 dans la fiche Société :

 

Sur le bulletin, l'absence est maintenant décomptée en jours :

 

📌 À noter : La méthode 142 n'est pas activée (valeur par défaut).

📚 Voir la fiche Méthodes - Absences.

Le maintien employeur de l'absence Paternité/Maternité ne se déclenche pas sur le bulletin

Pour rappel, légalement il n'est pas prévu de maintien mais uniquement une période de jours d'absence autorisée.

 

Pour déclencher un maintien alors que cela n’est pas prévu par la convention, se rendre dans les éléments variables du bulletin et ajouter le profil de prime ICEMP :

Que faire lorsqu’il y a de la maladie et des congés sur la même période ?

Deux motifs d'absence différents ne doivent pas être saisis en même temps.

En effet, pour un salarié qui est malade pendant ses congés il y a 2 options :

  • Soit la maladie suspend les CP : Si d'un commun accord avec l'employeur, le salarié peut reporter ses congés. Dans ce cas-là le salarié n'est plus en CP pour la période concernée mais en arrêt maladie ;
  • Soit le salarié est en congés et dans ce cas il n'y a aucun maintien de l'employeur car pour ce dernier le salarié est en congés et non en maladie.
    Le salarié devra envoyer l'attestation de salaire à la CPAM pour percevoir directement des IJSS (il n'y a pas de subrogation de l'employeur). Au niveau du bulletin, il y aura uniquement la période de CP décomptée.

Attestation de salaire 

Je souhaite modifier les informations dans mon attestation de salaire 

⚠️ Attention :

Les montants de l'attestation de salaire doivent correspondre aux montants des salaires rétablis véhiculés en DSN mensuelles. Une exploitation fonctionnelle des DSN étant faite par les CPAM/MSA pour le calcul des indemnisations journalières de sécurité sociale.

Toute modification de ces montants sur l'attestation de salaire dématérialisée dans My Silae entraîne un précalcul IJSS modifié, sans que ceci ne soient véhiculés dans le fichier de la DSN évènementielle d'arrêt. En effet, seules les DSN mensuelles véhiculent ces salaires rétablis.

Par conséquent, il pourrait y avoir un écart de calcul IJSS entre My Silae et les organismes de sécurité sociale.

 

Toutefois, pour modifier l'attestation de salaire :

  1. Supprimer la Date de démarrage de la DSN  pour "La DSN Arrêt de travail"  et "La DSN fin de contrat" :
  2. Modifier l'attestation
  3. Remettre les dates d'origine de démarrage de la DSN sur "La DSN arrêt de travail" ainsi que "La DSN fin de contrat"
  4. Envoyer la déclaration
Pour quelle raison il y a 12 mois dans l'attestation de salaire à la place des 3 mois, sans avoir modifié le calcul du maintien "Sur la base des salaires rétablis des n mois précédents" dans la fiche Société ? 

Pour certaines catégories de salariés (VRP, travailleurs à domicile et certains salariés en activité discontinue), le programme récupère automatiquement les 12 derniers mois au lieu des 3 derniers mois pour compléter l'attestation de salaire.

 

📌 À noter :

Pour supprimer des périodes, modifier temporairement la date de démarrage de la DSN (il faut penser à la remettre à l'identique après la manipulation) :

Mon arrêt de travail/Accident de travail (ou maladie non professionnelle) débute le dernier jour du mois et le salaire ne s'indique pas dans l'attestation de salaire, est ce normal ? 

Oui, c'est normal. En effet si on va dans l'activité en passant par le bulletin, l'attestation sera vide car le logiciel n'aura pas les éléments du bulletin.
Dans cette situation, il convient dans un premier temps de calculer le bulletin concerné par l'absence.

Puis, depuis le menu de Traitement de mois > Saisie de l'activité, l'attestation peut être générée avec le ou les salaires de références.


Cotisations

Comment paramétrer la Garantie Arrêt de Travail (GAT) ?

Pour appliquer la GAT sur un dossier du BTP, il conviendra de se rendre dans le questionnaire conventionnel de la fiche Société et d’activer les coches suivantes :

 

En effet, sans ce paramétrage, le maintien de salaire s’appliquera sur le bulletin.


Indemnités journalières (IJSS) 🆕

Tableau comparatif des règles générales de calcul et de plafonnement des IJSS selon trois situations : maladie non professionnelle, accident du travail/maladie professionnelle, maternité (pour un salarié mensualisé) :

 

Maladie non professionnelle

Accident de travail / Maladie Non Professionnelle

Maternité

Base juridique

Assurance maladie Branche risques professionnels Assurance maternité

Salaire de référence

Trois derniers salaires bruts précédant l'arrêt Salaire brut du mois précédant l'arrêt Trois derniers salaires bruts précédant le congé

Salaire journalier de base

Total des trois salaires bruts / 91.25 Salaire brut du mois précédent / 30.42 Total des trois salaires / 91.25

Plafonnement du salaire pris en compte

1.4 x SMIC mensuel maximum - SMIC du dernier jour du mois civil de la période de référence 0.834% du PASS - PSS en vigueur au jour de l'AT ou reconnaissance de la MP PMSS mensuel

Taux d'indemnisation 

50% du salaire journalier de base 60% du salaire journalier pendant les 28 premiers jours, puis 80% à partir du 29ème jour Environ 100% du salaire net (dans la limite du plafond)

Délai de carence

Trois jours Aucun délai de carence Aucun délai de carence

📌 À noter :

Des règles spécifiques peuvent s’appliquer pour des cas plus spécifiques – tels que les salariés en base forfaitaire, avec abattements, non mensualisés, etc.

Les BPIJ ne remontent pas dans le logiciel
  1. Cela concerne tous les salariés : Vérifier que l'inscription au service d'envoi DSIJ a bien été réalisée.

  2. Cela ne concerne que certains salariés ou certaines périodes :
    • Si vous êtes sur Net-entreprise, vérifier que le fichier est bien disponible sur la plateforme et transmettre une impression écran lors de votre demande d'assistance.
    • Si vous êtes sur JeDeclare :
      • Vérifier que le fichier est bien disponible sur la plateforme et transmettre une impression écran lors de votre demande d'assistance.
      • S’il n'est pas présent et que tous les paramétrages sont conformes, prendre contact avec JeDeclare afin qu’ils rétablissent le lien vers le logiciel de paie.
Pourquoi les IJSS nettes ne se calculent pas sur le bulletin ? 

Vérifier ces points :

  • Vérifier que les dates de subrogation demandées dans l'attestation couvrent bien la période ;
  • Vérifier qu'il n'y a pas plusieurs attestations de salaire pour une même absence : Si c'est le cas supprimer les attestations en trop ;
  • La coche L'entreprise pratique la subrogation de la fiche Société doit être activée ;
  • La coche L'entreprise avance les IJSS de la fiche Société doit être désactivée, sinon elle désactive le calcul des IJSS.
  • L'absence est un temps partiel thérapeutique. Le temps partiel thérapeutique n'étant pas considéré comme une maladie, il n'y a donc pas d'IJSS sur le bulletin (il reste cependant possible d'utiliser les profils d'IJSS manuellement).

 

📌 À noter :

Il n'est pas possible de prolonger une période de subrogation.

En effet, il faut renseigner sur l’attestation la date maximale de subrogation au cas où le salarié serait prolongé.

📚 Voir la question n°7 de la fiche Questions / Réponses DSN.

Je constate une différence entre les IJSS brutes et les IJSS Nettes

Il y a 4 éléments à prendre en compte et à vérifier si besoin :

  • Les IJSS brutes dépendent du nombre de jours maintenus :
  • Les IJSS nettes dépendent des dates renseignées dans l’attestation de salaire :
  • Les IJSS brutes sont limitées au montant et à la durée (nombre de jours) du maintien
  • Vérifier et supprimer si besoin les doublons d’attestations de salaires dans l’activité
  • Aussi, la coche "L’entreprise avance les IJSS" de la fiche Société désactive le calcul sur le bulletin lorsqu’elle est activée.
Pourquoi des IJSS nettes sont présentes sur le bulletin alors que la subrogation est finie ?

Cela peut se produire lorsqu'une attestation de salaire est en attente de validation.

Vérifier s'il ne s'agit pas d'un cas listé ci-dessous :

  • Une attestation pour une prolongation a été faite à tort (il convient de supprimer l'attestation pour revenir sur l'attestation initiale)
  • L'absence est superposée sur un même jour
  • Le motif d'absence est différent du précédent
  • L'absence n'est pas continue

Pour supprimer ce déclenchement des IJSS, il sera nécessaire de confirmer la nouvelle attestation de salaire sans les dates de subrogation.

La CPAM limite le versement des IJSS dans le cadre d'un cumul emploi-retraite à 60 jours, comment l'appliquer ?

Cette limite n'est pas gérée par le logiciel. Il faut le faire manuellement.

Pour quelle raison y a-t-il des IJSS brutes alors qu'il n'y a pas de maintien employeur ? 🆕

Cela peut arriver lorsqu'il reste des jours à maintenir au niveau du compteur mais que le montant du maintien est à 0.

Il est possible de changer ce traitement en activant la méthode 398.

 

📚 Voir la fiche Méthodes - Absences.


Maintien

Comment est calculé le maintien ?

Lorsqu’il y a un maintien de salaire sans carence, la bulle de l’indemnité complémentaire se présente comme ceci :

 

Ces montants proviennent de 2 bulletins fictifs :

  1. Brut que le salarié aurait sans absence
  2. Brut avec absence

 

Dans le cas où il y a de la carence, la bulle de l’indemnité complémentaire se présente comme ceci :

 

  1. Brut que le salarié aurait sans absence – jours de carence (dans notre exemple on décompte 7 jours en absence non rémunérée)
  2. Brut avec absence
Le montant du maintien est supérieur au montant de l'absence, pourquoi ?

En effet :

  • Cela peut se produire lorsqu'une prime est incluse dans le montant du maintien ;
  • Cela peut également provenir de la méthode de calcul du maintien :

Le légal devenant plus favorable, il provoque en cumulé un écart de X

Le logiciel compare entre le maintien légal et le maintien conventionnel pour chaque absence et chaque mois.

Dès lors qu'un maintien devient plus favorable que l'autre en l'appliquant dès le début de l'absence, il effectue le changement de maintien en déclenchant également une ligne de régularisation.

 

Concernant l'écart cumulé : Les deux types de maintiens (légal et conventionnel) ne sont pas cumulables. Quand on passe sur l'un ou l'autre des types de maintien, le logiciel calcule ce qui aurait été versé depuis le début si celui-ci s'était appliqué dès le départ. S'il y a un écart négatif, alors il est régularisé.

Comment se calcule le maintien lorsqu’il se base sur les salaires rétablis des N mois précédents ?

Dans l’exemple ci-dessous, le salarié est absent 10 jours et le maintien s’effectue sur les bulletins des 3 mois précédents :

 

L’arrêt étant en 01/2024, le maintien sera sur les salaires rétablis d’octobre novembre et décembre 2023.

Les salaires rétablis sont présents dans les éléments calculés des bulletins :

 

Les données dont nous avons besoin pour le calcul :

  • Salaires rétablis :
    • Octobre 2023 : 2000
    • Novembre 2023 : 2000
    • Décembre 2023 : 2000
  • Nombre de jours calendaires moyens mensuels selon la sécurité sociale : 365/12 = 30.42
    • Donc 2000 * 3= 6000
    • 30,42 * 3 = 91,26
    • 6000 / 91,26 = 65,75
Le maintien ne se déclenche pas sur mon bulletin

Vérifier les points suivants :

  • Le salarié a épuisé ses droits au maintien (consulter les mois précédents)
  • La présence d’une fonction calcul qui bloquerait le déclenchement du maintien
  • Une ancienneté insuffisante ou modifiée par la présence d’information dans la partie "Informations complémentaires" de la fiche Salarié :
  • Si l'acquisition de l'ancienneté se fait au cours de la maladie, le maintien se déclenche uniquement si la CCN le précise.

    Si cela est précisé dans la CCN et que le maintien ne se déclenche pas, envoyer une demande d'assistance avec le texte officiel. Sinon, pas de droit au maintien.

  • Il faut que, dans la fiche Société, les champs "Calcul du maintien des salaires", "L’entreprise avance les IJSS" ou "L’entreprise pratique la subrogation" soient cochées :

    📌 À noter :

    Si la coche "L’entreprise avance les IJSS" est cochée, il n’y aura pas d’IJSS sur le bulletin.

  • Si le salarié n'a pas d'historique (reprise de dossier, transfert de salarié, etc.), le maintien peut ne pas se calculer si le paramétrage en fiche Société ou Salarié indique que le maintien doit être réalisé sur la base des salaires N mois rétablis :

    Dans ce cas, modifier le nombre de mois appliqué ou basculer sur un maintien sur la base du bulletin en cours.
  • L’entreprise applique la Garantie Arrêt de Travail ou bien la prévoyance prend en charge le maintien
  • Date d’entrée erronée ou absente dans la fiche Salarié :
  • Une classification absente ou erronée dans la fiche Salarié :
Le maintien enfant malade ne se déclenche pas

Vérifier que la partie Enfants - Personnes à charge est remplie et que la coche "À charge" est bien activée en fiche Salarié :

Le maintien ne se régularise pas

Le maintien ne se régularise pas automatiquement comme les absences. En effet, dans ce cas de figure, il convient alors de le gérer manuellement.

Pour le maintien vous avez le profil ICEMP, dans les éléments variables, ainsi que des profils d’IJSS.

Initialisation du nombre de jours déjà maintenus

Pour initialiser le nombre de jours déjà maintenus en cas de reprise de dossier, il faut ajouter le profil INITNBJM dans les éléments variables.

 

📌 À noter : L'initialisation est nécessaire lorsque les bulletins fictifs ont été importés via les DSN. En effet seuls les bulletins en production permettent la récupération de l'historique de traitement du maintien de salaire.

Je souhaite / ne souhaite pas déduire la CSG de mon ajustement du net, comment faire ? 

Activer la méthode 005 avec la valeur N ou O.

 

📚 Voir la fiche Méthodes - Absences.

Pourquoi l'ajustement du net est plafonné ?

L'ajustement du net ne peut pas être supérieur à la somme du maintien et des IJSS et donc provoquer un maintien négatif pour le salarié.

 

📚 Voir la fiche L'ajustement du net.

Pourquoi je n'ai pas d'ajustement du net sur le maintien ?

Vérifier que :

  • La CCN prévoit bien un maintien du net ;
  • Le maintien conventionnel n'a pas été modifié en spécifique sur le dossier via une fonction calcul.

Nouvelles règles d'indemnisation CPAM 

Est ce que cette nouvelle règle s'applique sur tous les types d'absence du régime général ? 

Non cela s'applique uniquement aux arrêts maladie non professionnelle (MNP).

 

📌 À noter :

Pour les arrêts de travail de type Accident du travail (AT) et Maladie professionnelle (MP), seuls les jours couverts par un arrêt médical sont indemnisés de date à date.

Est-ce que le code absence 112 (Maladie non professionnelle sans carence IJSS) peut toujours être utilisé ? 

Non, il n’est pas utile ni approprié d’utiliser ce choix de code absence. Le champ Type d’arrêt permet de gérer les calculs en intégrant les nouvelles règles des CPAM.

Est-ce que le régime agricole suit les mêmes règles que le régime général ? 

L'alignement des consignes données par le régime agricole à partir du 1er janvier 2026 confirme que la gestion des arrêts de prolongation doit être gérée de manière identique aux dispositions du régime général dans mySilae Gestionnaire de Paie.

 

 

Voici la communication reçue par le GIP-MDS et la CCMSA pour les conditions d'application au 1er janvier 2026 :

À l’image de l’évolution apportée côté Régime Général le 1er septembre 2024, depuis le 1er janvier 2026 la MSA a mis fin à la tolérance d’indemnisation des jours non prescrits entre deux avis d’arrêt de travail en cas de prolongation. Une communication a récemment été effectuée par les caisses MSA auprès des employeurs concernés avec les éléments suivants :

En application de l’article L. 321-1 du code de la sécurité sociale (CSS) pour les salariés agricoles et l’article L. 732-4 du code rural et de la pêche maritime (CRPM) pour les non-salariés agricoles, le versement des indemnités journalières à l’assuré par l’organisme d’assurance maladie est subordonné à la constatation par le médecin ou par la sage-femme de l’incapacité physique de continuer ou de reprendre le travail qui se formalise par un avis d’arrêt de travail indiquant les éléments d’ordre médical justifiant l’interruption de travail, ainsi que sa durée. Ainsi, les jours non couverts par un avis d’arrêt de travail ne peuvent faire l’objet d’une indemnisation.

 

Ce qui est appliqué à partir du 1er janvier 2026 :

  • La MSA harmonise le traitement des périodes non prescrites entre deux arrêts de travail pour les salariés et les non-salariés.
  • Fin de la dérogation : les périodes (en jours calendaires) sans prescription médicale ne seront plus indemnisées.
    • Si interruption sans arrêt de travail inférieure ou égale à 48h : Les jours non couverts par un avis d’arrêt de travail ne sont pas indemnisés, mais l’arrêt de prolongation n’est pas soumis au délai de carence de 3 jours.
    • Si interruption sans arrêt de travail supérieur à 48h : Les jours non couverts par un avis d’arrêt de travail ne sont pas indemnisés, la reprise de travail est présumée (seul un arrêt de travail de prolongation couvrant la période peut lever la présomption) et le délai de carence s’applique à cette nouvelle prescription. Une nouvelle DSN évènementielle ou attestation de salaire doit être réalisée avec le nouveau DJT.
    • Cette règle est déjà appliquée aux arrêts pour accidents du travail (AT) et maladies professionnelles (MP).

Pour rappel, lorsque l’avis d’arrêt de travail est coché "initial" par le prescripteur, une nouvelle carence est appliquée.

 

Est-ce que le régime public suit les mêmes règles que le régime général pour les arrêts de prolongation ?

Oui. Dans la fonction publique, chaque arrêt de travail fait l’objet d’un jour de carence non rémunéré. Lorsque le médecin prescrit un arrêt de travail de prolongation, si celui-ci est immédiatement successif à l’arrêt initial ou prescrit dans la limite de 2 jours calendaires après l’arrêt initial, alors le nouvel arrêt conserve bien la nature d’une prolongation. Aucun nouveau délai de carence de 1 jour ne s’appliquera à l’arrêt de prolongation. Dans le cas contraire, il s’agit d’une nouvelle absence initiale.

En DSN mensuelle, pour un arrêt de type "Prolongation" intervenu après une coupure de 1 ou 2 jours après l’arrêt initial, je visualise un bloc arrêt de travail S21.G00.60 distinct du bloc arrêt de travail de l’arrêt initial. Est-ce normal ? 

Oui, c’est normal. Ce qui compte, c’est d’avoir la même date pour le dernier jour travaillé (DJT) déclarée en DSN dans le bloc S21.G00.60.002. Ce DJT doit être identique pour l’arrêt initial et ses prolongations.

Les agents CPAM reçoivent en parallèle les volets médicaux 1 et 2 qui permettent d’identifier par ailleurs les arrêts de prolongation. Ils recoupent les informations de ces volets médicaux de prolongation avec les blocs d’arrêts S21.G00.60 véhiculés en DSN. Le DJT déclaré dans ces blocs est important car il sert à l’étude des droits pour les indemnisations IJSS.

Peut-on choisir le "Type d'arrêt" depuis My Silae Entreprise ? 

Les coches permettant de déterminer si l'arrêt de travail saisi est un arrêt de travail "Initial" ou de "Prolongation" sont proposées uniquement sur My Silae Gestionnaire de Paie.

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